Medical image processing

Retinal image processing

Andrey Nasonov, Alexander Semashko, Alexandra Chernomorets, Vladmir Sergeev, Andrey Krylov

Developing a system for automatical processing of retinal images to assist a doctor to make a diagnosis. The project includes:

  • Detection of structural elements: optical disc, macula, blood vessels
  • Detection of exudates
  • Blood vessels analysis

res_ophtalmology.png

Computer Tomography image filtering

Nikolay Mamaev, Alexey Lukin, Dmitry Yurin

Publications

2016

А. А. Довганич, А. В. Насонов, А. С. Крылов, Н. В. Махнева. «Иммунофлюоресцентная диагностика и анализ образцов ее изображений при аутоиммунной пузырчатке» // Российский журнал кожных и венерических болезней, т. 19, №. 1, 2016, с. 31−35.

А. А. Довганич, А. В. Насонов, А. С. Крылов, Н. В. Махнева. «Метод анализа изображений образцов ткани кожи при иммунофлюоресцентной диагностике аутоиммунной пузырчатки» // Российский журнал кожных и венерических болезней, т. 19, №. 2, 2016, с. 87−87.

A. A. Dovganich, Y. A. Pchelintsev, A. V. Nasonov, A. S. Krylov, N. V. Makhneva. “Ridge-based method for pemphigus diagnosis on immunofluorescence images” // In: Proceedings of the 26th International Conference on Computer Graphics and Vision GraphiCon'2016. 2016, pp. 170−174. PDF.

2015

A. Yatchenko, A. Krylov. “Cross-Frame Ultrasonic Color Doppler Flow Heart Image Unwrapping” // Lecture Notes in Computer Science, Vol. 9126, 2015, pp. 265−272.

A. M. Yatchenko, A. V. Gavrilov, E. V. Boldyreva, I. V. Arkhipov, E. V. Grigorieva, I. M. Godkov, V. V. Krylov. “Blood Flow Prediction and Visualization within the Aneurysm of the Middle Cerebral Artery after Surgical Treatment” // In: Proceedings of IMTA-5 2015. Germany, Berlin, 2015, pp. 108−113.

2014

A. M. Yatchenko, A. S. Krylov, V. A. Sandrikov, T. Yu. Kulagina. “Regularizing method for phase antialiasing in color doppler flow mapping” // Neurocomputing, Vol. 139, Elsevier BV, 2014, pp. 77−83.

А. А. Насонова, А. С. Крылов. «Выделение сосудов на изображениях глазного дна и его оценка качества» // Биотехносфера, №. 3, Издательство "Политехника", 2014, с. 24−25.

A. Yatchenko, A. Krylov, A. Gavrilov, V. Sandrikov, T. Kulagina. “Image preprocessing for color doppler flow antialiasing using power and complex phase data” // In: Proceedings of International Conference on Signal Processing (ICSP2014). IEEE, Hangzhou, China, 2014, pp. 1072−1076.

N. Mamaev, A. Lukin, D. Yurin. “HeNLM-3D: A 3D Computer Tomography Image Denoising Algorithm” // In: The 12th International Conference on Pattern Recognition and Information Processing. United Institute of Informatics Problems of the National Academy of Sciences of Belarus, 28–30 May 2014, Minsk, Belarus, 2014, pp. 176−180. PDF.

N. V. Mamaev, A. S. Lukin, D. V. Yurin. “HeNLM–LA: a Locally Adaptive Nonlocal Means Algorithm Based on Hermite Functions Expansion” // Programming and Computer Software, Vol. 40, No. 4, Pleiades Publishing, Ltd., 2014, pp. 199−207. PDF_(draft,en).

2013

A. M. Yatchenko, A. S. Krylov. “Iterative phase unwrapping in color Doppler flow mapping” // Lecture Notes in Computer Science, Vol. 7751, 2013, pp. 330−338.

M. V. Storozhilova, A. S. Lukin, D. V. Yurin, V. E. Sinitsyn. “2.5D Extension of Neighborhood Filters for Noise Reduction in 3D Medical CT Images” // Lecture Notes in Computer Science, Vol. 7870, 2013, pp. 1−16. Springer.

A. M. Yatchenko, A. S. Krylov. “Regularization method for phase unwrapping in doppler ultrasound color flow medical imaging” // Computational Mathematics and Modeling, Vol. 24, No. 1, 2013, pp. 73−78.

A. M. Yatchenko, A. S. Krylov, A. V. Nasonov. “Deringing of MRI Medical Images” // Pattern Recognition and Image Analysis, Vol. 23, No. 4, Pleiades Publishing, Ltd, 2013, pp. 541−546. PDF.

А. С. Родин, В. С. Акопян, Н, С. Семенова, А. С. Крылов, А. С. Семашко, А. В. Насонов, А. А. Насонова. «Автоматизированный анализ изображений сетчатки для телемедицинского скрининга ретинопатий» // в: Современные технологии лечения витреоретинальной патологии-2013. 2013.

А. С. Лукин, М. В. Сторожилова, Д. В. Юрин. «Методы анализа качества фильтрации шума на изображениях компьютерной томографии» // в: Труды 15-й международной конференции "Цифровая обработка сигналов и её применение" (DSPA'2013), т. 2. 2013, с. 85−88. PDF.

Н. В. Мамаев, А. С. Лукин, Д. В. Юрин, М. А. Глазкова, В. Е. Синицын. «Алгоритм нелокального среднего на основе разложения по функциям Эрмита в задачах компьютерной томографии» // в: 23-я международная конференция по компьютерной графике и зрению GraphiCon'2013. Россия, Владивосток, 2013, с. 254−258. PDF.

M. V. Storozhilova, A. S. Lukin, D. V. Yurin. “Methods of noise filtering quality assessment for CT images” // In: Proceedings of 15-th International Conference "Digital Signal Processing and its Applications" (DSPA'2013), Vol. 2. Moscow, Russia, 2013, p. 88.

2012

A. M. Yatchenko, A. S. Krylov, A. V. Gavrilov, I. V. Arkhipov. “Building a three-dimensional dynamic model of left cardiac ventricle from ultrasonic data” // Pattern Recognition and Image Analysis, Vol. 22, No. 3, 2012, pp. 483−488.

А. С. Крылов, А. В. Насонов, А. С. Семашко, А. А. Черноморец, В. В. Сергеев, В. С. Акопян, А. С. Родин, Н. С. Семенова. «Компьютерный анализ изображений глазного дна» // в: Труды VIII Российско-Баварской конференции по биомедицинской инженерии. Санкт-Петербург, 2012, с. 129−133. PDF.

A. A. Chernomorets, A. V. Nasonov. “Deblurring in fundus images” // In: 22-th International Conference on Computer Graphics GraphiCon'2012. Moscow, Russia, 2012, pp. 76−79. PDF.

A. A. Chernomorets, A. S. Krylov. “Blur detection in fundus images” // In: IEEE Proceedings of 5th International Conference on BioMedical Engineering and Informatics (BMEI 2012). China, Chongqing, 2012, pp. 186−189. PDF.

A. Semashko, A. Yatchenko, A. Krylov, A. Bezugly, N. Makhneva, N. Potekaev. “Border extraction of epidermises, derma and subcutaneous fat in high-frequency ultrasonography” // In: 22-th International Conference on Computer Graphics GraphiCon'2012. Moscow, Russia, 2012, pp. 73−75.

А. М. Ятченко, А. С. Крылов. «Регуляризирующий метод восстановления фазы при ультразвуковом медицинском цветовом допплеровском картировании» // Прикладная математика и информатика, №. 40, МГУ, МАКС Пресс, Москва, 2012, с. 78−86.

M. V. Storozhilova, A. S. Lukin, D. V. Yurin, V. E. Sinitsyn. “Two approaches for noise filtering in 3D medical CT-images” // In: 22-th International Conference on Computer Graphics GraphiCon'2012. Moscow, Russia, 2012, pp. 68−72. PDF.

2011

A. S. Semashko, A. S. Krylov, A. S. Rodin. “Using Blood Vessels Location Information in Optic Disk Segmentation” // 16th International Conference on Image Analysis and Processing (ICIAP'2011), Lecture Notes in Computer Science, Vol. 6979, part 2, 2011, pp. 384−393.

A. M. Yatchenko, A. S. Krylov, A. V. Gavrilov, I. V. Arkhipov. “Graph-cut based Antialiasing for Doppler Ultrasound Color Flow Medical Imaging” // In: International Conference Visual Communications and Image Processing (VCIP2011). Taiwan, 2011, pp. 1−4.

A. M. Yatchenko, A. S. Krylov, A. V. Gavrilov, I. V. Arkhipov. “Reconstruction of the Inner Surface of the Left Ventricle of the Heart” // Pattern Recognition and Image Analysis, Vol. 21, No. 3, 2011, pp. 434−436. Springer.

A. A. Chernomorets, A. S. Krylov, A. V. Nasonov, A. S. Semashko, V. V. Sergeev, V. S. Akopyan, A. S. Rodin, N. S. Semenova. “Automated processing of retinal images” // In: 21-th International Conference on Computer Graphics GraphiCon'2011. Moscow, Russia, 2011, pp. 78−81. PDF.

A. S. Semashko, A. S. Krylov, A. S. Rodin. “Detection of optic disk boundary in eye fundus images using active contours” // In: Proceedings of 13-th International Conference “Digital Signal Processing and its Applications” (DSPA'2011), Vol. 2. Moscow, Russia, 2011, p. 183.

А. C. Семашко, А. С. Крылов, А. С. Родин. «Поиск границы диска зрительного нерва на изображениях глазного дна с использованием метода активных контуров» // в: Труды 13-й международной конференции «Цифровая обработка сигналов и её применение» (DSPA'2011), т. 2. 2011, с. 180−183.

A. V. Nasonov, A. A. Chernomorets, A. S. Krylov, A. S. Rodin. “Application of morphological amoebas method for blood vessel detection in eye fundus images” // In: Proceedings of 13-th International Conference “Digital Signal Processing and its Applications” (DSPA'2011), Vol. 2. Moscow, Russia, 2011, pp. 160−161.

А. В. Насонов, А. А. Черноморец, А. С. Крылов, А. С. Родин. «Применение метода морфологических амёб для выделения сосудов на изображениях глазного дна» // в: Труды 13-й международной конференции «Цифровая обработка сигналов и её применение» (DSPA'2011), т. 2. Москва, 2011, с. 158−161. PDF.

А. М. Ятченко, А. С. Крылов, А. В. Гаврилов, И. В. Архипов. «Нахождение движения стенки левого желудочка сердца по видеоданным МРТ и УЗИ» // в: Труды 13-й международной конференции «Цифровая обработка сигналов и её применение» (DSPA'2011), т. 2. Москва, 2011, с. 214−217.

A. M. Yatchenko, A. S. Krylov, A. V. Gavrilov, I. V. Arkhipov. “Left ventricle border tracking using MRI and US videodata” // In: Proceedings of 13-th International Conference “Digital Signal Processing and its Applications” (DSPA'2011), Vol. 2. Moscow, Russia, 2011, p. 217.

A. M. Yatchenko, A. S. Krylov, A. V. Nasonov. “MRI medical image ringing detection and suppression” // In: 8th Open German-Russian Workshop “Pattern Recognition and Image Understanding” (OGRW-8-2011). Lobachevsky State University of Nizhny Novgorod, November 21-26, 2011, 2011, pp. 259−262. PDF.

2010

A. M. Yatchenko, A. S. Krylov, A. V. Gavrilov, I. V. Arkhipov. “Left Ventricle 3D Model Reconstruction” // In: Proceedings of 10th Conference on Pattern Recognition and Image Analysis: New Information Technologies, Vol. 2. St. Petersburg, Russia, 2010, pp. 229−232.

A. A. Chernomorets, A. V. Nasonov, A. S. Krylov. “Adaptive method of eye blink artifact suppression in EEG” // In: Proceedings of 12-th International Conference and Exhibition “Digital Signal Processing and its Applications” (DSPA'2010), Vol. 2. 2010, pp. 321−322. PDF.

2009

A. M. Yatchenko, A. S. Krylov, A. V. Gavrilov, I. V. Arkhipov. “3D liver vessels model design using CT data” // In: GraphiCon'2009. Russia, Moscow, 2009, pp. 344−347. PDF.